Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERC3Q15034 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERC3Q15034 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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