Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPNMBQ14956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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