Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CBX2Q14781 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CBX2Q14781 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms