Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EBI3Q14213 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms