Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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SPIDRQ14159 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPIDRQ14159 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SPIDRQ14159 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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