Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL4A6Q14031 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL4A6Q14031 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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