Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RUNX2Q13950 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RUNX2Q13950 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms