Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NCOA4Q13772 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCOA4Q13772 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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