Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SEMA3FQ13275 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEMA3FQ13275 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
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