Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SRSF5Q13243 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SRSF5Q13243 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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