Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRDNQ13061 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRDNQ13061 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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