Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CDC16Q13042 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDC16Q13042 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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