Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD4Q12950 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXD4Q12950 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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