Protein–RNA interactions for Protein: Q12488

PSF1, DNA replication complex GINS protein PSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PSF1Q12488 DUG2YBR281C 2637 nt2.06□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 UFD4YKL010C 4452 nt2.06□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 YGR111WYGR111W 1203 nt2.05□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 RSR1YGR152C 819 nt2.05□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 PPE1YHR075C 1203 nt2.05□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 RGA1YOR127W 3024 nt2.05□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 BIT61YJL058C 1632 nt2.05□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 SAP185YJL098W 3177 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 UBX3YDL091C 1368 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 RSM24YDR175C 960 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 SWA2YDR320C 2007 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 CLN3YAL040C 1743 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 SAP190YKR028W 3102 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 SRL3YKR091W 741 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 RPL6BYLR448W 531 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 DLT1YMR126C 1029 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 HSP10YOR020C 321 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 ICS2YBR157C 768 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 BNI1YNL271C 5862 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 FIR1YER032W 2631 nt2.04□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 HOP1YIL072W 1818 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 DIG2YDR480W 972 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 SFT1YKL006C-A 294 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 YBL055CYBL055C 1257 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 DGK1YOR311C 873 nt2.03□□□□□ -2.08
PSF1Q12488 AFI1YOR129C 2682 nt2.03□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 AGE1YDR524C 1449 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YOL057WYOL057W 2136 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 TFC3YAL001C 3483 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 EDS1YBR033W 2760 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 KAP123YER110C 3342 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 TIF35YDR429C 825 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 TIM9YEL020W-A 264 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 VMA10YHR039C-A 345 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YHR212CYHR212C 336 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YAL037WYAL037W 804 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YLL044WYLL044W 447 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YAR060CYAR060C 336 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 FMP41YNL168C 780 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 MBA1YBR185C 837 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YBR292CYBR292C 372 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 NEL1YHR035W 1893 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 KSP1YHR082C 3090 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 URB2YJR041C 3525 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 MCD1YDL003W 1701 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 MDM36YPR083W 1740 nt2.02□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 TFB1YDR311W 1929 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 STH1YIL126W 4080 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 TIM11YDR322C-A 291 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 RGI1YER067W 486 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 VPS51YKR020W 495 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 LIP2YLR239C 987 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 GSP1YLR293C 660 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SRT1YMR101C 1032 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 AIM36YMR157C 768 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 PNO1YOR145C 825 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 IRC13YOR235W 315 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SPB1YCL054W 2526 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 ARK1YNL020C 1917 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SYO1YDL063C 1863 nt2.01□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 EMI1YDR512C 564 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 GCN4YEL009C 846 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 RPS24AYER074W 408 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YIL141WYIL141W 390 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 ATP7YKL016C 525 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 ARC18YLR370C 537 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YNL046WYNL046W 519 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YNL276CYNL276C 396 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YOL134CYOL134C 390 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YIL080WYIL080W 4722 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 ERT1YBR239C 1590 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 NOP56YLR197W 1515 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 MDM10YAL010C 1482 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SEN54YPL083C 1404 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 GCV2YMR189W 3105 nt2□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 TRM82YDR165W 1335 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 CPR5YDR304C 678 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SEC4YFL005W 648 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YHL044WYHL044W 708 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 CCE1YKL011C 1062 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 CTL1YMR180C 963 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 DGR1YNL130C-A 147 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 ATG19YOL082W 1248 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 RPN8YOR261C 1017 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 RRG8YPR116W 834 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 UTP22YGR090W 3714 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SCY1YGL083W 2415 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 HSC82YMR186W 2118 nt1.99□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 SSE1YPL106C 2082 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YPD1YDL235C 504 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 VEL1YGL258W 621 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 CWC24YLR323C 780 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt1.98□□□□□ -2.09
PSF1Q12488 PML39YML107C 1005 nt1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.2 ms