Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

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Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SDO1YLR022C 753 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YML084WYML084W 309 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 PAI3YMR174C 207 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 YOL150CYOL150C 312 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 CAT5YOR125C 702 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 STU2YLR045C 2667 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 CSR2YPR030W 3366 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 AEP1YMR064W 1557 nt3.28□□□□□ -1.88
HER1Q12276 SIZ1YDR409W 2715 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 MFA1YDR461W 111 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 NTF2YER009W 378 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YER079WYER079W 633 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 GET1YGL020C 708 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 TPM2YIL138C 486 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YIR040CYIR040C 333 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 RNP1YLL046C 750 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YNL150WYNL150W 408 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YOR105WYOR105W 327 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YOR248WYOR248W 303 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ARG5,6YER069W 2592 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 REG1YDR028C 3045 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ENA5YDR038C 3276 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ENA2YDR039C 3276 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ENA1YDR040C 3276 nt3.27□□□□□ -1.89
HER1Q12276 MDV1YJL112W 2145 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 GAL80YML051W 1308 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 CHS3YBR023C 3498 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 LST4YKL176C 2487 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YER087C-AYER087C-A 552 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YFL015CYFL015C 495 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YHR138CYHR138C 345 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 CSE4YKL049C 690 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YBL028CYBL028C 321 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 SPT10YJL127C 1923 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 JEN1YKL217W 1851 nt3.26□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YDL176WYDL176W 2127 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 PSF1YDR013W 627 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ATG31YDR022C 591 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YDR115WYDR115W 318 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 RSM24YDR175C 960 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 HTA1YDR225W 399 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ECL1YGR146C 636 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 TMA19YKL056C 504 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YKL069WYKL069W 543 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 SVS1YPL163C 783 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 CMD1YBR109C 444 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 SHG1YBR258C 429 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 EMP70YLR083C 2004 nt3.25□□□□□ -1.89
HER1Q12276 GCN1YGL195W 8019 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 snR68snR68 136 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 SLD5YDR489W 885 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YIR020CYIR020C 303 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ACF4YJR083C 930 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YMR141CYMR141C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YNL184CYNL184C 327 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YOL159CYOL159C 516 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YPR050CYPR050C 414 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 GPX2YBR244W 489 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 TGL3YMR313C 1929 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 MSH2YOL090W 2895 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YMR018WYMR018W 1545 nt3.24□□□□□ -1.89
HER1Q12276 FMP32YFL046W 624 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 VPS63YLR261C 327 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 MYO5YMR109W 3660 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 RSM19YNR037C 276 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YPL107WYPL107W 747 nt3.23□□□□□ -1.89
HER1Q12276 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 NUP60YAR002W 1620 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 CDH1YGL003C 1701 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 MUD2YKL074C 1584 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 ARF1YDL192W 546 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YAP3YHL009C 993 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 PAU13YHL046C 363 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YHR125WYHR125W 306 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 DLS1YJL065C 504 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 RPS28BYLR264W 204 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 SEC22YLR268W 645 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YML099W-AYML099W-A 330 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 CTK3YML112W 891 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 SSN8YNL025C 972 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 NGL1YOL042W 1092 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 GRE2YOL151W 1029 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 TPK2YPL203W 1143 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 VPS9YML097C 1356 nt3.22□□□□□ -1.89
HER1Q12276 RPN3YER021W 1572 nt3.21□□□□□ -1.89
HER1Q12276 HFD1YMR110C 1599 nt3.21□□□□□ -1.89
HER1Q12276 YEL075CYEL075C 369 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 AIM11YER093C-A 414 nt3.21□□□□□ -1.9
HER1Q12276 YIL175WYIL175W 318 nt3.21□□□□□ -1.9
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