Protein–RNA interactions for Protein: Q12242

RUP1, UBA domain-containing protein RUP1, yeastyeast

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUP1Q12242 EST3YIL009C-A 546 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YJR020WYJR020W 333 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YKR033CYKR033C 426 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YPR050CYPR050C 414 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 EAP1YKL204W 1899 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 URK1YNR012W 1506 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RIM13YMR154C 2184 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 TOR1YJR066W 7413 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 LIN1YHR156C 1023 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 CDC123YLR215C 1083 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 VMA6YLR447C 1038 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 CAT5YOR125C 702 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 POP7YBR167C 423 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 CDC37YDR168W 1521 nt2.76□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 FLO11YIR019C 4104 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ECM21YBL101C 3354 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YBT1YLL048C 4986 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 TRA1YHR099W 11235 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RIX1YHR197W 2292 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 BMH2YDR099W 822 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 HMO1YDR174W 741 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 HMF1YER057C 390 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RPL11BYGR085C 525 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 BAT1YHR208W 1182 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 SMA2YML066C 1110 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 URA5YML106W 681 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RPL11AYPR102C 525 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ADY4YLR227C 1482 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 AGE1YDR524C 1449 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 SLK19YOR195W 2466 nt2.75□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YKL100CYKL100C 1764 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 AXL1YPR122W 3627 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 TAF2YCR042C 4224 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RPL14BYHL001W 417 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YJL147CYJL147C 1149 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 DAD2YKR083C 402 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RPL8BYLL045C 771 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 SEC66YBR171W 621 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 KHA1YJL094C 2622 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 LST4YKL176C 2487 nt2.74□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 PSK1YAL017W 4071 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 VHR2YER064C 1518 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YPR1YDR368W 939 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RSM28YDR494W 1086 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YEA4YEL004W 1029 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 PEF1YGR058W 1008 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 RPL27AYHR010W 411 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 PCL5YHR071W 690 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 COA4YLR218C 453 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YPL142CYPL142C 318 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ERT1YBR239C 1590 nt2.73□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YIL054WYIL054W 318 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 SYS1YJL004C 612 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 INP1YMR204C 1263 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 SRL4YPL033C 846 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 LCL1YPL056C 306 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YPR014CYPR014C 330 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YCL019WYCL019W 5313 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ADF1YCL058W-A 342 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 YNL193WYNL193W 1677 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ARK1YNL020C 1917 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 KEL2YGR238C 2649 nt2.72□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ESC1YMR219W 4977 nt2.71□□□□□ -1.97
RUP1Q12242 ANR2YKL047W 1551 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 PDC2YDR081C 2778 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 SRO77YBL106C 3033 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 YDR248CYDR248C 582 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 KEI1YDR367W 666 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 PGD1YGL025C 1194 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 YGL109WYGL109W 324 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 YIP5YGL161C 933 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 TCD1YHR003C 1290 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 AFT2YPL202C 1251 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 VPS30YPL120W 1674 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 URB2YJR041C 3525 nt2.71□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 BOI1YBL085W 2943 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 MAL33YBR297W 1407 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 DBP10YDL031W 2988 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 YDL158CYDL158C 309 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 MBB1YJL199C 327 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 RCN1YKL159C 636 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 SDO1YLR022C 753 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 LIP2YLR239C 987 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 YBR051WYBR051W 351 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 SUS1YBR111W-A 291 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 BIT61YJL058C 1632 nt2.7□□□□□ -1.98
RUP1Q12242 PUF6YDR496C 1971 nt2.7□□□□□ -1.98
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