Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 NPR3YHL023C 3441 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 TCB2YNL087W 3537 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 PAU10YDR542W 363 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 PAU11YGL261C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RFA3YJL173C 369 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YAL037WYAL037W 804 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RPS29AYLR388W 171 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 PAU4YLR461W 363 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 IRC21YMR073C 606 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SPT14YPL175W 1359 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 UTP15YMR093W 1542 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 FAR11YNL127W 2862 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ROG1YGL144C 2058 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 PPH3YDR075W 927 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SLU7YDR088C 1149 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 AST2YER101C 1293 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YGR107WYGR107W 450 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 CMC1YKL137W 336 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RPF2YKR081C 1035 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 NYV1YLR093C 762 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 PEX17YNL214W 600 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ATX1YNL259C 222 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ISU1YPL135W 498 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 MBA1YBR185C 837 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RLF2YPR018W 1821 nt2.67□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SDC25YLL016W 3147 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 snR76snR76 109 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SMD3YLR147C 306 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YAP7YOL028C 738 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SGT1YOR057W 1188 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 HEM4YOR278W 828 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YPR050CYPR050C 414 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 NEL1YHR035W 1893 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SLS1YLR139C 1932 nt2.66□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YDR338CYDR338C 2088 nt2.65□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 TRS130YMR218C 3309 nt2.65□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YDR133CYDR133C 336 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 HTB1YDR224C 396 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YER189WYER189W 369 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 PEF1YGR058W 1008 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 OTU2YHL013C 924 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YLR050CYLR050C 486 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 PET20YPL159C 762 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YLR446WYLR446W 1302 nt2.65□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YBT1YLL048C 4986 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RPS1AYLR441C 768 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SMA2YML066C 1110 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RPB8YOR224C 441 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RPL33AYPL143W 324 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 TOM1YDR457W 9807 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 AMS1YGL156W 3252 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 KRE33YNL132W 3171 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 GYP7YDL234C 2241 nt2.64□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RPL11BYGR085C 525 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 CSI2YOL007C 1026 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RPL11AYPR102C 525 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RRP15YPR143W 753 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 COG3YER157W 2406 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 POL3YDL102W 3294 nt2.63□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YME2YMR302C 2553 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SSP1YHR184W 1716 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 PUF4YGL014W 2667 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SUI2YJR007W 915 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 MST28YAR033W 705 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 NEJ1YLR265C 1029 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RIM9YMR063W 720 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YBL062WYBL062W 381 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 GRE2YOL151W 1029 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SWA2YDR320C 2007 nt2.62□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YJL181WYJL181W 1836 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 BPT1YLL015W 4680 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RPA190YOR341W 4995 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RAV2YDR202C 1056 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YGR053CYGR053C 852 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SIP3YNL257C 3690 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 STI1YOR027W 1770 nt2.61□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 BAS1YKR099W 2436 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 MRP10YDL045W-A 288 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RSM27YGR215W 333 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 COX6YHR051W 447 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YIL174WYIL174W 228 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 TPK3YKL166C 1197 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YKR033CYKR033C 426 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RNP1YLL046C 750 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 ESF2YNR054C 951 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 TPK2YPL203W 1143 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 JID1YPR061C 906 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 snR24snR24 89 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SEC66YBR171W 621 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 SHG1YBR258C 429 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 PAM1YDR251W 2493 nt2.6□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 TPS2YDR074W 2691 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 ESL2YKR096W 3588 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 RGA2YDR379W 3030 nt2.59□□□□□ -1.99
NFI1Q12216 CBS2YDR197W 1170 nt2.59□□□□□ -1.99
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