Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
AP1B1Q10567 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP1B1Q10567 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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