Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC15Q0P6D6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC15Q0P6D6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms