Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FAM27E3Q08E93 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM27E3Q08E93 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms