Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNB2Q08289 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms