Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SRSF4Q08170 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms