Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FMODQ06828 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FMODQ06828 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
FMODQ06828 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FMODQ06828 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms