Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RUNX1T1Q06455 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RUNX1T1Q06455 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms