Protein–RNA interactions for Protein: Q05541

NSE3, Non-structural maintenance of chromosome element 3, yeast

Predictions only

Length 303 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NSE3	Q05541	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	AFB1	YLR040C	675 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SYM1	YLR251W	594 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YPR145C-A	YPR145C-A	237 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	PCK1	YKR097W	1650 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YNL193W	YNL193W	1677 nt		4.12	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	UTP15	YMR093W	1542 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	OSH3	YHR073W	2991 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	COX23	YHR116W	456 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YIR020C	YIR020C	303 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	BYE1	YKL005C	1785 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	CBP2	YHL038C	1893 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SKN7	YHR206W	1869 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SNU56	YDR240C	1479 nt		4.11	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ASM4	YDL088C	1587 nt		4.1	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	snR56	snR56	88 nt		4.1	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YJR037W	YJR037W	384 nt		4.1	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	ADI1	YMR009W	540 nt		4.1	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	NTC20	YBR188C	423 nt		4.1	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RNT1	YMR239C	1416 nt		4.1	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	KRI1	YNL308C	1776 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SRB4	YER022W	2064 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	GYL1	YMR192W	2163 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YJL169W	YJL169W	369 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	COX8	YLR395C	237 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	SVS1	YPL163C	783 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	YPR077C	YPR077C	372 nt		4.09	□□□□□ -1.75
NSE3	Q05541	RRI2	YOL117W	1938 nt		4.09	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	REG1	YDR028C	3045 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	MGT1	YDL200C	567 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	IRC2	YDR112W	309 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	ADY4	YLR227C	1482 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YOR331C	YOR331C	558 nt		4.08	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	SPO13	YHR014W	876 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	RSM19	YNR037C	276 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	URB2	YJR041C	3525 nt		4.07	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	TMA64	YDR117C	1698 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	DAL5	YJR152W	1632 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	VBA4	YDR119W	2307 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	STE23	YLR389C	3084 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	KHA1	YJL094C	2622 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	FLO5	YHR211W	3228 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	CWC24	YLR323C	780 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YMR173W-A	YMR173W-A	1185 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	RSA1	YPL193W	1146 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	PIS1	YPR113W	663 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YTA7	YGR270W	4140 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	MYO3	YKL129C	3819 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	STP2	YHR006W	1626 nt		4.06	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	RPA135	YPR010C	3612 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YCG1	YDR325W	3108 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	PUG1	YER185W	912 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YGR018C	YGR018C	330 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YGR053C	YGR053C	852 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	tV(CAC)D	tV(CAC)D	73 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	tV(CAC)H	tV(CAC)H	73 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YKL063C	YKL063C	504 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YKT6	YKL196C	603 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	GOT1	YMR292W	417 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	PBI2	YNL015W	228 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	HHF2	YNL030W	312 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	PRM3	YPL192C	402 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YPR096C	YPR096C	303 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	snR42	snR42	351 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	UBP16	YPL072W	1500 nt		4.05	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	JJJ2	YJL162C	1752 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	REC8	YPR007C	2043 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	COX13	YGL191W	390 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	PET54	YGR222W	882 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YIR036W-A	YIR036W-A	402 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	SDO1	YLR022C	753 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	ENV10	YLR065C	546 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YLR171W	YLR171W	390 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YMR052C-A	YMR052C-A	366 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	RRT16	YNL105W	429 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	SET1	YHR119W	3243 nt		4.04	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	SSF1	YHR066W	1362 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	MSH2	YOL090W	2895 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	IRC9	YJL142C	393 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	SRL3	YKR091W	741 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	AIM4	YBR194W	372 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	DNM1	YLL001W	2274 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	DBF20	YPR111W	1695 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	YKL222C	YKL222C	2118 nt		4.03	□□□□□ -1.76
NSE3	Q05541	SPA2	YLL021W	4401 nt		4.03	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	YEL1	YBL060W	2064 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	CEP3	YMR168C	1827 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	STE6	YKL209C	3873 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	SSP1	YHR184W	1716 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	BNA7	YDR428C	786 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	YGL015C	YGL015C	393 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	RPB9	YGL070C	369 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	LIF1	YGL090W	1266 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	YKL044W	YKL044W	321 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	PFY1	YOR122C	381 nt		4.02	□□□□□ -1.77
NSE3	Q05541	YOR169C	YOR169C	465 nt		4.02	□□□□□ -1.77

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