Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATP7AQ04656 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATP7AQ04656 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms