Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBE1Q04446 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms