Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP4Q02446 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP4Q02446 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SP4Q02446 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SP4Q02446 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms