Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APBA1Q02410 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APBA1Q02410 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms