Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SATB1Q01826 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms