Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EXOSC10Q01780 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EXOSC10Q01780 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms