Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFITM3Q01628 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFITM3Q01628 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms