Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SPTBN1Q01082 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPTBN1Q01082 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms