Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BEX3Q00994 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BEX3Q00994 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms