Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP1Q00587 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms