Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTF2BQ00403 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2BQ00403 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms