Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HTRA4P83105 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HTRA4P83105 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms