Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBP5P82980 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP5P82980 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP5P82980 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP5P82980 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP5P82980 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBP5P82980 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBP5P82980 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms