Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX3P78415 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX3P78415 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX3P78415 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX3P78415 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX3P78415 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX3P78415 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX3P78415 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX3P78415 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX3P78415 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX3P78415 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX3P78415 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms