Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CNTNAP1P78357 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTNAP1P78357 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms