Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBB4BP68371 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB4BP68371 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms