Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CACNG7P62955 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms