Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVS71-1P61550 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVS71-1P61550 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms