Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCCD1P59942 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCCD1P59942 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms