Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NME5P56597 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME5P56597 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME5P56597 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME5P56597 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME5P56597 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NME5P56597 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NME5P56597 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NME5P56597 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NME5P56597 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NME5P56597 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NME5P56597 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms