Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
OXCT1P55809 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OXCT1P55809 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms