Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNU13P55769 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNU13P55769 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNU13P55769 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNU13P55769 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNU13P55769 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms