Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PLTPP55058 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PLTPP55058 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PLTPP55058 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PLTPP55058 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PLTPP55058 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms