Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDST1P52848 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NDST1P52848 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDST1P52848 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDST1P52848 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDST1P52848 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDST1P52848 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDST1P52848 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDST1P52848 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NDST1P52848 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NDST1P52848 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NDST1P52848 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NDST1P52848 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms