Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF135P52742 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms